Synergel™, 100 g

1. Wie hoch konzentriert soll das Agarosegel sein (in %)?

2. Das Gel wird auf jeden Fall 0,7 % Agarose enthalten (minimale Agarosemenge, die für die Gelstabilität benötigt wird). Ziehen Sie also 0,7 % von der Agarosekonzentration ab.

3. Teilen Sie den Rest durch 2. Das Resultat gibt die zusätzlich benötigte Synergel™-Menge an.

Beispiel:
Umrechnen eines 1 % Agarosegels in ein 1 % Synergel™/Agarosegel

a. Ziehen Sie 0,7 % von 1 % Agarose ab: 1 % - 0,7 % = 0,3 %

b. Teilen Sie den Rest durch 2 : 0,3 % : 2 = 0,15 %

c. 0,15 % (150 mg / 100 ml) ist die Synergel™-Menge, die zu den 0,7 % Agarose (0,7 g / 100 ml) zugegeben werden muss, um ein Gel funktionell äquivalent zu einem 1 % Agarosegel zu erhalten.

Synergel™ ist ein synergistisches Gel- und Trennungsagenz aus modifizierten Polysacchariden, die in Kombination mit Agarose ein durch Wasserstoffbrücken stabilisiertes binäres Gelsystem bilden.
Die Zugabe von Synergel™ zu Agarose verbessert deutlich die Geleigenschaften und resultiert in einer erhöhten Trennschärfe und verbesserten Darstellung von DNA-Fragmenten bis zu einer Größe von 30 kb. Eine Mischung aus 0,7 % Agarose und 0,7 % Synergel™ entspricht in ihren Trenneigenschaften etwa einem reinen 2 % Agarosegel.
Synergel™ resultiert außerdem in sehr klaren Gelen und erleichtert so Auswertung und Photodokumentation.

Standard Puffersysteme wie phosphat-, acetat- oder boratgepuffertes Tris-EDTA können für die Gelelektrophorese mit Agarose/Synergel™ verwendet werden. Auch die Trennung von RNA mit 2,2 M Formaldehydpuffer ist wie gewohnt möglich. Synergel™ ist weiterhin kompatibel mit der Elektroelution von Nukleinsäure und allen herkömmlichen Membran-Transfermethoden nach Southern/Northern Blotprotokollen.

Die Abbildung zeigt einen Vergleich der Gelmischungen.
A: 1,5 % Synergel™ / 0,7 % Agarose und B: 4 % hochauflösende Agarose (NuSieve^®).
Siehe auch Abbildungen zu pUC19 Markern T149 und X901.